四合院里最重要的房间就是正房。由于祖宗牌位及堂屋设在正房的中间，所以正房在全宅中所处地位最高，正房的开间、进深和高度等方面在尺度上都大于其他房间。正房的开间一般为三间，中间为祖堂，东侧往往住祖父母，西侧住父母。这种尊左的习俗，也反映在厢房上，东厢房住大儿子、三儿子。西厢房住二儿子、四儿子。

正房两侧大都再建耳房，耳房与正房一样也是面南，只不过是尺度稍小。如果将正房比喻为人的脸部，那么，耳房就象人的双耳。两侧耳房有各有一间的称为“明三暗五”各有两间的称为“明三暗七”耳房前面正对的东西厢房的北山墙，耳房前恰好形成一对小院子，一些文人也将书房设在耳房，极好的读书环境。

正房后面的一排房屋叫做后罩房，后罩房的开间很多，由于不是正房，故不受宅制之制约。后罩房一般是女儿及女佣所居住的地方，由于后罩房位于院落的最后，所以最为私密。

后罩房位于院子的最北端，而院子最南端的一排门朝北的房间，被称为倒座房。倒座房最东为私塾，依次为门房或男仆居室、大门、会客间，最西边是厕所。

北京四合院的房间里面用仿古地砖铺地，而墙面顶棚都用白纸裱糊，窗子是支摘窗，窗子的棂格并不复杂，窗花是最好的装饰品。北京的窗花当年为红毛边纸剪刻，透底的地方完全镂空，贴在窗子的白纸上，颇为精美。